La SCCPO-RRII obtiene su estructura del Reglamento de Sociedades Científicas Estudiantiles de la U.C.B, un Estatuto, dedicado a las disposiciones fundamentales y permanentes, y un Reglamento Interno, dedicado a regir el funcionamiento y operaciones de la Sociedad.

Las instancias de organización que derivan del Reglamento de Sociedades Científicas Estudiantiles son: i) Tutor, ii) Asamblea General y iii) Consejo Directivo.

Las instancias que derivan del Reglamento Interno son los Comités, responsables de  colaborar con el funcionamiento de la SCCPO-RRII y el desempeño de labores institucionales, y las Comisiones de Trabajo encargados de la elaboración, ejecución y evaluación de proyectos de la Sociedad Científica.